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  1. 在线设计引物网站有哪些-如何快速设计shRNA

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要进行shRNA载体构建,首先需要根据自己的基因,设计出对应的 靶点 、 loop序列 , 酶切位点序列 ,详见 LncRNA的shRNA慢病毒载体引物设计 - 引物先用10000g在4°离心2min,再按照说明书的要求,加入DEPC或者无酶ddH2O将寡核苷酸稀释为100 μM。

基因研究中,敲除基因,研究该基因的功能是最常用的套路。一般 ShRNA 可通过 RNA 干扰来抑制基因的表达, 是基因研究中必不可少的环节。下面就主要围绕设计 ShRNA 引物序列,手把手教你构建 ShRNA 质粒,轻松敲基因。

没有书籍。自己上google搜索这些PCR设计的关键字,看几篇文献就好了。百度文库里就有很多,你先看看普及下基础。

首先是实验设计 详情见:CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA设计 https://www.jianshu.com/p/8222f449cb44 sgRNA的合成和投递有两种方式:A)PCR;B)单独的sgRNA的表达质粒。A)PCR扩增的方法 U6:来源于人U6小核启动子,常用小RNA 表达,转录本为shRNA。

有趣的是,除了短双链RNA,短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA),比如茎环结构在细胞内经过加工后也可以变成siRNA,从而产生RNA干扰(7)。这使得构建表达干扰RNA的载体,从而使哺乳动物细胞内基因表达长期沉默成为可能(8)。

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